Aan het slot van het vorige deel in de apenreeks, Escape, werd het koppel Cornelius en Zira gedood, maar hun pasgeboren baby Milo werd gered door de circusdirecteur Armando, die het aapje omdoopte tot Caesar en voor de buitenwereld verborgen hield. In tussentijd heeft een epidemie alle honden en katten uitgeroeid en hebben de apen noodgedwongen hun rol overgenomen. Ook werden de apen afgericht om huishoudelijke taken te verrichten en gebruikt voor wrede medische experimenten. Als Caesar ontdekt dat zijn mede-apen in slavernij leven, besluit hij een revolutie te ontketenen ...
Dit is het donkerste en meest gewelddadige deel uit de hele reeks. In het scenario zijn diverse directe verwijzingen verwerkt naar de rassenrellen in de Amerikaanse maatschappij uit de jaren vijftig en zestig van de vorige eeuw. In het oorspronkelijke slot werd de gouverneur die had bevolen om de opstand van de apen bloedig neer te slaan, zelf door de woedende apen vermoord, maar na negatieve reacties bij proefvoorstellingen, werd de scène vervangen door een meer vreedzame boodschap. Ook werden er enkele bloedige scènes verwijderd om de keuringscommissie mild te stemmen.
Zelfs in de gecensureerde versie is dit een vrij grimmige aflevering. Maar het wordt ook allemaal wat oppervlakkiger: de aanpak is meer gericht op actie en de bespiegelingen over evolutie en intelligentie uit de eerdere delen blijven achterwege. De vertolkingen lijken ook wat minder geïnspireerd dan in de eerdere delen (de uitzondering is McDowall, die volledig met zijn apenpersonages lijkt te zijn vergroeid).
Het oorspronkelijke einde kan hieronder worden bekeken:
